El Instituto Milenio Fundamentos de los Datos (IMFD) ha definido desarrollar y administrar su trabajo a través de un Directorio Ejecutivo que velará por el cumplimento de los objetivos del centro. Este directorio estará compuesto por las cuatro unidades estratégicas que cubren el quehacer integral del IMFD: la Dirección de Investigación y Formación Académica, Dirección de Innovación y Transferencia Tecnológica, Dirección de Comunicaciones y Extensión, y Dirección de Administración y Finanzas.

Cada dirección cuenta con un director(a) científico(a) y un(a) director(a) de unidad, además de los equipos de trabajo propios de cada departamento.

Con estas cuatro áreas funcionando bajo una sola estructura, en sinergia y constante comunicación, el IMFD busca que la información que es clave para el instituto fluya transversalmente y se fortalezca la capacidad de mirar en macro nuestro trabajo, y definir de manera efectiva el rumbo del instituto.

La estructura es la siguiente: